シナリオモード、群雄モードそれぞれでクリアした回数に応じてポイントを入手。入手したポイントの範囲内で、好きな武将を選んでプレイを開始することができる。ポイントはクリアする毎に3ptずつアップしていき、選ぶ時には一人当たり10ptが必要となる。ただし、絆化された武将であれば必要なポイントは1～3 ptと大幅に減少する。

※シナリオモードでは他のシナリオ大名家の武将は選択不可。

※クリアポイントは『戦極姫３』で既にクリアした回数がそのまま引き継がれる。

「自動」か「手動」の切り替えだった合戦方法の選択に「任意」を新たに追加。合戦毎に自動か手動かを選択できるようになった。

また、難易度「普通」でのCPUの思考も強化。プレイヤーには、より積極的な攻撃の仕掛けが求められる。

※思考強化は新規に「普通」で始めた場合に適用される。

武将一覧に『寵愛』ボタンを追加。お気に入りの武将にチェックを入れるとその武将がソートで優先される。

装備したアイテムによる能力増加の補正値を、武将一覧と武将詳細で表示。

また、装備の際には、外すことなく別の装備を選べたり、誰が装備中なのかを一覧でわかるように改善。