海路を経由して敵の城に侵攻した場合、今作では海戦が発生します。海戦で有効な新しいスキル（特殊能力）の追加もあり、史実で海軍を率いた武将の活躍が高まりました。

また、新たな海路も加わって、これまでとは違った新たな戦略が必要となってきます。

新システムとして「控え武将」を導入！従来は6人で攻めると城の武将の配置枠がいっぱいとなるため、合戦に勝利しても敵武将全員が切腹していましたが、今作では、降伏した武将が一旦控え武将として配下に加わることで、武将の配置枠を気にすることなく攻め込むことができるようになりました。

「控え武将」になった武将は、いつでも好きな時に配置して戦力に加えることが可能です。